今年1月23日，有一個稱為「台灣建國聯盟」的組織，在《台灣日報》以半版巨幅廣告，刊登該組織之政黨登記證號、通訊處電話號碼及劃撥帳號以及活動消息等等；嗣又於同月26日刊登類似內容於《自由時報》。因該組織與本聯盟「台灣獨立建國聯盟」名稱上僅二字之差，為避免社會大眾有混淆誤解之虞，本聯盟特提出澄清如下：
一、據悉，上列刊登廣告之「台灣建國聯盟」係成立於2005年12月10日，同月27日即獲內政部核准登記為政黨組織，政黨證字116號，現任主席為吳清先生。
本聯盟稱「台灣獨立建國聯盟」，簡稱為「台獨聯盟」，現任主席為黃昭堂博士。本聯盟未曾申請立案；亦不願申請登記為「中華民國」的政黨。
二、台灣獨立建國聯盟以建立自由、民主、平等、福祉、公義之台灣共和國為宗旨。其前身可追溯於1960年在海外台灣人留學生組成的台獨運動團體。當時自中國敗退的蔣政權佔領管理台灣，以高壓統治手段，迫害台灣人追求民主、自決的權利，因而引起台灣人抗爭；然而在白色恐怖威脅下，在國內既難以自由表達心聲和活動，只好先在國外成立組織發展。嗣至1970年，為了結合海外獨立運動的力量，分設於各國的四個較大海外獨立運動團體（日本台灣青年獨立聯盟、加拿大台灣人權委員會、美國全美台灣獨立聯盟和歐洲台灣獨立聯盟）乃與島內台灣自由聯盟共同組成世界性的「台灣獨立聯盟」，並於1987年改名為「台灣獨立建國聯盟」。
三、台灣獨立建國聯盟四十多年來對台灣獨立建國的倡議和行動，突顯台灣問題，訴請和爭取國際社會重視台灣人的建國權，其組織的發展和從事運動的歷程，皆有珍貴的長遠歷史軌跡可循。迄至1992年，台灣獨立建國聯盟更突破一切困難闖關遷台，匯聚國內外民主運動力量，不斷奮鬥抗爭，終於使台獨運動漸漸得以公開化。現在全體盟員都仍繼續奉獻心力，期望帶動台灣社會的覺醒，早日撥開台灣內外政治陰霾，達成台灣獨立建國的志望－－追求建立台灣共和國，不達目標決不終止。
以上說明，懇請社會大眾務必細究分辨，庶幾可避免不必要的混淆、疑慮與誤解，則幸甚。若有疑惑，敬請不吝惠予指教！
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台灣獨立建國聯盟敬啟
2006年2月17日