一、主權對人權的重要性：
主權是一個國家在其國內有絕對而無限制之權力，為其他國家不能干預者。在民主國家，其主權在於全民。因此，主權與人權息息相關，憲法第二條即明定：「中華民國之主權屬於國民全體」，足證主權乃國民的基本人權。主權如落在獨裁政權或外來政權手中，則人權即失去民主的保障，人權就無立足之地。一個國家主權不確立或受威脅，人民的命運就易為他國或外來政權所主宰，一旦失去主權，人權嚴重受害結果莫此為甚。
主權乃國家的基本權利 (fundamental rights )，其他國家有尊重此基本權利之義務。所以，國家主權至少要包括生存權、獨立權、平等權、領土管轄權。這四種權利在一九一六年美洲國際法學會( American Institute of International Law ) 決議之「國家權利與義務宣言」( Declaration of the Rights and Duties of Nations )即將上述四種權利明白列出，並規定這些權利應受他國之尊重及保障(第五條)。可見，主權對人權有相當重要的互動關係。尤其是生存權被視為最重要的基本人權，民主國家的主權與人民生存權更密不可分，國家有主權，人民的生存權才有確實保障。
二、失去主權對人權之侵害：
國家失落主權，不是成為殖民地，就是成為附庸國狀態，人民無自主權利，人權之保障就蕩然無存。
台灣曾經是荷蘭的殖民地，也為日本佔據統治過。這些時期台灣無任何國家主權，自無人權可言，台灣人早就飽受無國家而人權受害之經驗，失去主權對人權之侵害，已不喻自明。
由於台灣的主權未能確立，不受到他國之認定及尊重，在國外台灣人的尊嚴常受辱損，此由護照常要附加另紙之簽證，並常受刁難，才能入境他國的事實可知。更嚴重的是，台灣漁船常為鄰近東南亞國家所扣留，遭受不公平的處罰，而政府卻無力救援，更說明了國家主權不被承認或尊重，以致人民的人權受蹂躝的因果關係。
國民黨政府來台統治五十五年之久，以「一個中國」政策，使台灣沒有獨立的主權，導致台灣的民主受利於「收復大陸、統一中國」的口號下，由此產生許多違反民主、損害人權的臨時條款及動員勘亂時期特別法律，並維持戒嚴至一九八七年七月十五日。在此種戡亂體制下，總統可一直連任，大陸選出的國會議員永不改選，省長及院轄市長官派而非民選產生….。凡此等等均是違反民主及人權的事實，而此等事實即肇因於不落實於台灣主權的結果。雖然現在已解除戒嚴、開放黨禁、報禁、國會全面改選及總統直選，但是尚未能建立名實相符的獨立主權，在國際上台灣仍然處處受制，不能以代表國家的名稱參加國際組織，以致中國武力犯台之威脅日益加深，拑制宗教信仰、迫害民運人士、禁止組織，若不使台灣有獨立的主權，就不可能免台灣人權受侵害之恐懼，更是台灣前途之最大危機。
三、破壞台灣主權對台灣人權的災害：
台灣主權未能受到國際的承認及尊重，其主權包含的生存權、獨立權、平等權、領土管轄權及自衛權就已面臨危機，對台灣全體住民的人權自生不利之後果。而中國處心積慮要破壞台灣的國家主權，以達併吞台灣的目的，更會成為對台灣人權最大的災害。
台灣主權若被中國破壞而佔有，則現在尚有受些微保障的民主及人權，在中國獨裁專制的共產主義統治之下，必被剝奪殆盡。從中國迫害異己及人權工作者之事實，以及天安門事件、法輪功事件以觀，中共根本視人民為芻狗，毫不尊重人權。至今，西藏人民受欺壓殘害的事仍時有所聞，其對佔領地區之侵害人權已視為家常便飯。則台灣一旦落入中國手中，自不容許台灣人民比中國人民有較好的權利。中國人民連要求民主的權利都沒有，台灣人民的也不能例外。
即使是台灣引以為傲的經濟成長，在被中國併吞合為一國以後，縱使不被直接破壞，在大陸十三億人口普遍落後的經濟影響之下，也必不能再享受目前的富裕生活，香港被歸併以後，漸漸失去 自主權及經濟大不如前，即為顯例。尤於中國以武力侵犯台灣時，台灣人權即受生命權及生存權被剝奪的立即危險。因此，確立台灣的獨立主權，亦是保障台灣人權的最重要任務。
預防性的危機處理為優先 建立台灣主權確保台灣人權
一、更正「一個中國」政策的錯誤，落實台灣主權之獨立：
中國大陸與台灣分裂成為二個不同政體，各有其國號、國旗及中央政府，在國際上各自代表自己的政權，已是不爭的事實。「中國」就是中共政權統治所及的大陸，「台灣」就是國民黨政權所管轄的「台灣」，「中國」是「中國」，「台灣」就是「台灣」，這種正確清楚的事實及觀念，不能予以混淆錯亂。否則對中共的「中國」反而有利，可以大吃小，將「台灣」歸入他們的「中國」，而「台灣」則會盡受其害，不但不能統一或奪回「中國」，連保住「台灣」都成問題。
台灣政府既然只承認台灣有統治權，就應以台灣住民的意願為依歸，實施台灣全面民主政府，修改憲法( 甚或制定新憲 )，使其適用於台灣，不應再繼續用無立場、無資格及無能力主張的「統一中國」神話，愚弄人民、作賤自己。
台灣全體住民更應覺醒，認清「一個中國」是對岸的中國，不是現住的台灣。在台灣就要做有國家主權的「台灣」人。血統種族是天生的，而且是個人的DNA 之事，不必互相爭論亦不容他人干預；國籍係依各國國籍法之規定而有，也可任人選擇或變更。新加坡是一主要由華人建立的獨立國家，他們就有正確的「一個中國」政策與觀念，他們可以「華人」血統為榮，但是他們自稱是「新加坡人」，不是「中國人」。他們與中國來往，稱他們是「中國人」，歡迎李登輝訪問新加坡，稱他是「台灣來的總統」，非常簡單明瞭、清楚正確，沒人敢說新加坡人數典忘祖，更沒人反新加坡獨立於「中國」之外。天安門事件發生後，亞洲週刊六月廿五日期第五頁報導：「東南亞各地華人在作出反應時，基本上顧及自己已在海外落葉歸根，而非中國人的身份」，有新加坡人還沾沾自喜地說：「幸好我不是中國人」，這也是正確的「一個中國」思想的顯例。新加坡有少數的馬來亞及印度種族的國民，台灣亦有非中華民的原住民，為何彈丸之地的新加坡能成為獨立自立的新國家，而大於新加坡五十多倍的台灣不能？此正係肇始於「一個中國」錯誤政策與觀念之遺害。
二、以正確的「台灣」史實名稱進入國際社會：
自一九七九年美國承認中國後，對「中華民國」都用「台灣」為正式名稱。而維繫彼此關係的「台灣關係法」，係以「台灣」代表一個國家或政治實體的名稱。而美國國務院編印的世界各國背景簡介中，對各國均用其正式國名，唯有「台灣背景簡介」即印出：「Official Name Taiwan」(正式名稱台灣)。為台灣最依賴的世界第一強國都用「台灣」看待，世界各國在國際場合，除了「台灣」不稱呼自己為「台灣」外，恐怕已鮮有人將「台灣」稱為「中國」或「中華民國」的。
即使一般人民到了國外，也被外國人稱呼為「台灣人」，就如出口的商品一律都用「Made in Tawain」( 台灣製造 )一樣正確又自然。反而如果自稱為「中國人」，則必需說明是在台灣的「中華民國」人，或係種族上的「華人」，外國人才能明白。否則，稱為「中國」( China )或「中華」( Chinese )的英文，咸都被認為是指對岸大陸的「中華人民共和國」。唯有以「台灣」名稱才不會造成混淆，蓋其可讓人明白所指稱者，乃係又名「福爾摩莎」(Formosa)的「台灣」。
「台灣」是正確且符合歷史事實的名稱，要建立台灣的國家獨立主權，必先從正名開始。如繼續使用別人不承認，自己也心虛的「中國」或「中華」名稱，只有遂中華人民共和國在代表「一個中國」的強勢下，視「台灣」為「中國」的地方政府的陰謀目的而已。中共已取得「中國」的「商標專利權」，台灣用相同或相似的名稱，就像使用「仿冒品」一般，其弊害可知。國際社會既然僅承認中華人民共和國為「中國」，台灣使用名正言順的「台灣」名稱進入國際社會，始會被人接受，在國際上才有立足點，台灣的主權也才有獨立的基礎。
三、與中國維持平等正常的國際外交關係：
「一個中國」為目的，乃在消滅台灣的獨立主權。「中華人民共和國」為代表有獨立主權的「中國」，且在聯合國是其係有否決權的安全理事國，台灣已不可能、也不必以「一個中國」與之相抗衡。台灣要確保台灣的主權，必須先定位與中國的關係，面對事實，明白承認中國係一獨立之「他國」，其與台灣間之關係，乃國家與國家間之對等關係。並以此為基礎，發展兩國間平等互惠之和平關係，方係對雙方均有利之長遠政策，始可永遠解除台灣前途之危機。
台灣人民主張台灣主權，亦係主張自己的人權。因為主權在民，台灣人民成為國家的主人始能保障人權。台灣若失去主權，台灣人民就會任人宰割，尤其在共產的獨裁專制統治下，人權難有容身之處。可見，台灣的主權有變動，台灣的人權必隨之受影響。所以，只有確立台灣的國家獨立主權，真正實行主權在民的民主政治，台灣人民始有人權的堅固屏障，台灣前途始能免除最大的危機。
2000年國際人權研討會聲明
值世界人權宣言五十二週年，美麗島廿一週年之際，由以下各團體主辦之2000年國際人權研討會經今日整天學者之引言、與會者全體之討論。茲發表聲明如下:
一、台灣人民歷經外來政權四百年來之統治，有許多人權受害之悲慘經驗，更深知人權保障比人類之食衣住行更為重要。對新政府陳水扁總統將在世界人權日宣佈特赦21名人權受害者，本會予以高度肯定及支持。此種平反冤案之特赦應持之以恆，並期待新政府積極完成司法改革，減免侵害人權案件之發生次數。
二、台灣人權狀況雖大有進步，但仍難免有所疏失，亟待早日成立國家人權委員會，以落實及促進台灣人權之保障。
三、鑒於人權係世界性，台灣亦應以聯合國世界人權宣言、國際特赦組織宗旨、歐洲人權組織等國際人權水準為指標。使台灣進入世界人權先進國家之列，大力貢獻於世界人權運動。
四、台灣的民主自由各種人權在歷年來各界人權鬥士之犧牲奉獻之下，已有頗著成效。尤在今年5月20日台灣首度開始政黨輪替之民主政治，對今後促進各種人權，更應積極繼續促進及實現。
五、目前對於台灣人權最大威脅來自對台灣主權之不能完全確立，且正遭受內外之搖撼及催殘。本會呼籲台灣人民不分朝野及黨派，大家同心協力確立及保衛台灣主權，尤其要避免被中國併吞及爭取國際支持，即以保障台灣人權必須保全台灣主權為第一優先要務。對於任何妨害或威脅台灣主權之個人、團體或國家，即視同侵害台灣人權之加害人，必須予以預防及制止之。
六、立法院在野立委於12月6日對於國立虎尾技術學院邀請呂副總統演講為由，刪除校方l百萬元一事，本會對此妨害學術自由及拑制到元首之言論自由，視自由人權於無物之行為，加以強烈譴責，並呼求台灣選民亦予以唾棄。